
تعداد نشریات | 22 |
تعداد شمارهها | 485 |
تعداد مقالات | 5,045 |
تعداد مشاهده مقاله | 9,290,967 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,135,394 |
کاربرد سیستم الکتروفورز ژل عمودی پلیاکریلآمید بهینه و مقرونبهصرفه با رنگآمیزی اتیدیوم بروماید در بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای آفتابگردان با استفاده از نشانگر مولکولی TRAP | ||
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
مقاله 7، دوره 9، شماره 1، خرداد 1397، صفحه 69-79 اصل مقاله (723.46 K) | ||
نوع مقاله: علمی - پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22084/ab.2018.14593.1362 | ||
نویسندگان | ||
حسین زینل زاده تبریزی* ؛ آرش حسین پور | ||
استادیار پژوهشی، بخش تحقیقات علوم زراعی و باغی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان اردبیل، سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، اردبیل (مغان)، ایران | ||
چکیده | ||
در این پژوهش کاربرد روش جدید الکتروفورز ژل پلیاکریلآمید با استفاده از رنگآمیزی اتیدیوم بروماید برای بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای آفتابگردان با استفاده از نشانگر مولکولی نوین TRAP ارائهشده که نسبت به روشهای متداول رنگآمیزی نقره و نشاندار کردن آغازگرها با فلورسنت، دارای مزیتهایی همچون مقرونبهصرفه بودن، سرعت بالای تجزیه، تجزیه تعداد زیادی نمونه در واحد زمان (196 × 2) در هر آزمایش و همچنین استفاده مجدد از ژلها میباشد. 6 آغازگر ثابت و 6 آغازگر تصادفی نشانگر مولکولی TRAP بهکاررفته توسط این روش الکتروفورز 19 ترکیب نشانگری ایجاد کردند که از میان 116 نوار ایجادشده توسط نشانگر TRAP، 109 تای آنها چندشکل بودند. میانگین تعداد نوارهای چندشکل 79/5 بود. اندازه قطعات آشکارشده بین 25-920 جفت باز بود. محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) این نشانگر بین 03/0 و 50/0 با میانگین 33/0 بود. ترکیب نشانگری (MAX3BR و Sa12) با محتوای اطلاعات چندشکل 49/0 چندشکلترین جایگاه بود. نتایج آزمایش نشان داد که این روش نهتنها در آشکارسازی محصولات نشانگرهای ریزماهواره بلکه در سایر نشانگرها مانند TRAP که تعداد زیادی نوار چندشکل تولید میکنند میتواند بسیار مفید واقع شود. | ||
کلیدواژهها | ||
آفتابگردان؛ تنوع ژنتیکی؛ چندشکلی؛ الکتروفورز | ||
مراجع | ||
Anonymous. 2017. The Compositae Genome Project (CGP) Web Site: http://cgpdb.ucdavis.edu/. Barata, C., and Carena, M. 2006. Classification of North Dakota maize inbred lines into heterotic groups based on molecular and testcross data. Euphytica, 151(3): 339-349. Dowling, C.D., Burson, B.L., Foster, J.L., Tarpley, L. and Jessup, R.W. 2013. Confirmation of pearl millet-napiergrass hybrids using EST-derived simple sequence repeat (SSR) markers. American Journal of Plant Sciences, 4(5): 1004. Fiust, A., Rapacz, M., Wójcik-Jagła, M. and Tyrka, M. 2015. Development of DArT-based PCR markers for selecting drought-tolerant spring barley. Journal of applied genetics, 56(3): 299-309. Fu, Y.-B., Peterson, G.W., Richards, K.W., Tarn, T.R. and Percy, J.E. 2009. Genetic diversity of Canadian and exotic potato germplasm revealed by simple sequence repeat markers. American Journal of Potato Research, 86(1): 38-48. Gelin, J., Forster, S., Grafton, K., Mcclean, P. and Rojas-Cifuentes, G. 2007. Analysis of seed zinc and other minerals in a recombinant inbred population of navy bean (Phaseolus vulgaris L.). Crop Science 47(4): 1361-1366. Genovesi, A.D., Jessup, R.W., Engelke, M.C. and Burson, B.L. 2009. Interploid St. Augustinegrass [Stenotaphrum secundatum (Walt.) Kuntze] hybrids recovered by embryo rescue. In Vitro Cellular Developmental Biology-Plant, 45(6): 659-666. Henareh, M., Dursun, A., Abdollahi-Mandoulakani, B. and Haliloğlu, K. 2016. Assessment of genetic diversity in tomato landraces using ISSR markers. Genetika, 48(1): 25-35. Hu, J. and Vick, B.A. 2003. Target region amplification polymorphism: a novel marker technique for plant genotyping. Plant Molecular Biology Reporter, 21(3): 289-294. Kadaru, S.B., Yadav, A.S., Fjellstrom, R.G. and Oard, J.H. 2006. Alternative ecotilling protocol for rapid, cost-effective single-nucleotide polymorphism discovery and genotyping in rice (Oryza sativa L.). Plant Molecular Biology Reporter, 24(1): 3-22. Mir, R., Kumar, N., Jaiswal, V., Girdharwal, N., Prasad, M., Balyan, H., and Gupta, P. 2012. Genetic dissection of grain weight in bread wheat through quantitative trait locus interval and association mapping. Molecular Breeding, 29(4): 963-972. Naghavi, M., Ghareyazie, B. and Hosseini Salekdeh, Gh. 2005. Molecular Markers. Tehran. University Press. p 320. Quezada, M., Pastina, M.M., Ravest, G., Silva, P., Vignale, B., Cabrera, D., Hinrichsen, P., Garcia, A.A.F. and Pritsch, C. 2014. A first genetic map of Acca sellowiana based on ISSR, AFLP and SSR markers. Scientia Horticulturae, 169: 138-146. Wang, D., Shi, J. Carlson, S., Cregan, P., Ward, R. and Diers, B. 2003. A low-cost, high-throughput polyacrylamide gel electrophoresis system for genotyping with microsatellite DNA markers. Crop Science, 43(5): 1828-1832. Weiguo, Z., Zhihua, Z., Xuexia, M., Yong, Z., Sibao, W., Jianhua, H., Hui, X., Yile, P. and Yongping, H. 2007. A comparison of genetic variation among wild and cultivated Morus species (Moraceae: Morus) as revealed by ISSR and SSR markers. Biodiversity and Conservation, 16(2): 275-290. Yoshida, T. 2004. Genetic diversity among Japanese cultivated sorghum assessed with simple sequence repeats markers. Plant Production Science, 7(2): 217-223. Zeinalzadeh-Tabrizi, H., Haliloglu, K. and Razban Haghighi, A. 2015a. Genetic diversity of sunflower genotypes (Helianthus annuus L.) using TRAP markers. Journal of Crop Biotechnology, 4(12): 39-53. ZeinalzadehTabrizi, H., Hosseinpour, A., Aydin, M. and Haliloglu, K. 2015b. A modified genomic DNA extraction method from leaves of sunflower for PCR based analyzes. Journal of Biodiversity and Environmental Sciences, 7(6): 222-225. ZeinalzadehTabrizi, H., Sahin, E. and Haliloglu, K. 2011. Principal components analysis of some F1 sunflower hybrids at germination and early seedling growth stage. Journal of the Faculty of Agriculture (Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi), 42(2): 103-109. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 361 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 320 |