
تعداد نشریات | 22 |
تعداد شمارهها | 485 |
تعداد مقالات | 5,045 |
تعداد مشاهده مقاله | 9,290,946 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,135,385 |
بررسی تنوع ژنتیکی چهار نژاد از گوسفندان موجود در ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهوارهای | ||
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
مقاله 7، دوره 8، شماره 1، خرداد 1396، صفحه 59-66 اصل مقاله (839.93 K) | ||
نوع مقاله: علمی - پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22084/ab.2017.2271 | ||
نویسندگان | ||
محمدتقی واجدابراهیمی* 1؛ محمدرضا محمدآبادی2؛ علی اسماعیلی زاده2 | ||
1دانشآموخته کارشناسیارشد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان | ||
2استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان | ||
چکیده | ||
با توجه به اهمیت شناسایی و حفظ تنوع ذخایر ژنتیکی کشور، چهار جمعیت از نژادهای گوسفند موجود در ایران (پاکستانی (25 رأس)، کرمانی (102 رأس)، ایرانبلک (44 رأس) و لریبختیاری (25 رأس)) با استفاده از 4 نشانگر ریزماهوارهای (McMA2، HSC، OarHH35 و BM6444) از نظر تنوع ژنتیکی بررسی شدند. استخراج DNA ژنومی از تعداد 196 نمونه خون به روش نمکی بهینه شده، انجام شد و واکنشهای PCR با استفاده از چهار جفت آغازگر اجرا شد. نتایج نشان داد که تمامی جایگاهها چندشکل هستند. تعادل هاردی- واینبرگ به روش آزمون مربع کای نشان داد که برخی ترکیبات مختلف جایگاهها- جمعیت در حالت عدم تعادل قرار داشتند (05/0>P). بیشترین تعداد آلل مشاهده شده مربوط به جایگاه HSC در جمعیت پاکستانی (14 آلل) و کمترین تعداد نیز از آن جایگاه HSC در جمعیتهای کرمانی و ایرانبلک (7 آلل) بود. حداکثر محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) در حالت ترکیب جمعیت- جایگاه برای جایگاههای McMA2، HSC، OarHH35 و BM6444 بهترتیب 9/0، 87/0، 87/0 و 86/0 بودند. در مجموع میتوان نتیجه گرفت که جمعیتهای گوسفند مورد بررسی در این تحقیق با توجه به جایگاههای مورد مطالعه، از تنوع ژنتیکی نسبتاً بالایی برخوردارند. | ||
کلیدواژهها | ||
هتروزیگوسیتی؛ جمعیت؛ آلل؛ چندشکلی | ||
مراجع | ||
Abadi, M. R. M., Askari, N., Baghizadeh, A. and Esmailizadeh, A. K. 2009. A directed search around caprine candidate loci provided evidence for microsatellites linkage to growth and cashmere yield in Rayini goats. Small Ruminant Research, 81: 146-151. Arora, R. and Bhatia, S. 2006. Genetic diversity of Magra sheep from India using microsatellite analysis. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 19(7): 938-942. Barker, J. S. F. 1994. A global protocol for determining genetic distances among domestic livestock breeds. Proceedings of the 5th world congress on genetics applied to livestock production. University of Guelph, Guelph Canada, 21: 501-508. Bhatia, S. and Arora, R. 2008. Genetic diversity in Kheri-A pastoralists developed Indian sheep using microsatellite markers. Indian Journal of Biotechnology, 7: 108-112. Botstein, D. White, R. L., Skolnick, M. and Davis, R. W. 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. The American Journal of Human Genetic, 32: 314-331. Buchanan, F. C., Adams, L. J., Littlejohn, R. P., Maddox, J. F. and Crawford, A. M. 1994. Determination of evolutionary relationships among sheep breeds using microsatellites. Genomics, 22: 397-403. Buchanan, F. C. and Thue, T. D. 1998. Intrabreed polymorphic information content of microsatellites in cattle and sheep. Canadian Journal of Animal Science,78: 425-428. Chauhan, T., Lal, K. K., Mohindra, V., Singh, R., Punia, O., Gopalakrishnan, A., Sharma, P. C. and Lakra, W. S. 2007. Evaluating genetic differentiation in wild populations of the Indian major carp. Aquaculture, 269: 135-149. Crispim, B. D. A., Seno, L. D. O., Egito, A. A. D. E., Junior, F. M. D. V. and Grisolia, A. B. 2014. Application of microsatellite markers for breeding and genetic conservation of herds of Pantaneiro sheep. Electronic Journal of Biotechnology, 17: 317-321. Davis, G. H., Galloway, S. M., Ross, I. K., Gregan, S. M., Ward, J., Nimbkar, B. V., Ghalsasi, P. M., Nimbkar, C., Subandriyo, G. D., Inounu, I., Tiesnamurti, B., Martyniuk, E., Eythorsdottir, E., Mulsant, P., Lecerf, F., Hanrahan, J. P., Bradford, G. E. and Wilson, T. 2002. DNA test in prolific sheep from eight countries provide new evidence on origin of the booroola FecB mutation. Biology of Reproduction, 66: 1869-1874. Esmail-Khanian, S., Nejati, J. A., Afraz, F., Daneshyar, P. and Ghanbari, S. 2007. Genetic variation among Baluchi sheep population using microsatellitemarkers. Iranian Journal of Science Technology Agriculture Nature Research, 11: 41(In Persian). Hepsibha, P., Karthickeyan, S. M. K. and Guru, V. 2014. Microsatellite marker based assessment of genetic structure of Coimbatore breed of sheep (Ovis aries) in Tamil Nadu. Indian Journal of Biotechnology, 13: 203-206. Jakaria, Z., Sulandari, M. S., Subandriyo, A. and Muladno, S. 2012. The use of microsatellite markers to study genetic diversity in Indonesian sheep. Journal of the Indonesian Tropical Animal Agriculture, 37(1):1-9. Khaldari, M. 2008. Sheep and goat husbandry. University of Tehran Press, 572. Kumar, D., Sharma, R., Pandey, A. K., Gour, D. S., Malik, G., Ahlawat, S. P. S. and Jain, A. 2007. Genetic diversity and bottleneck analysis of Indian Bellary Sheep by Microsatellite Markers. Russian Journal of Genetics, 43(9): 996-1005. Lang, K. D. M., Wang, Y. and Plante, Y. 1996. Fifteen polymorphic dinucleotide microsatellites in llamas and alpacas. Animal Genetics, 27: 285-294. Maddox, J. F., Riffkin, C. D. and Beh, K. J. 2000. Dinucleotide repeat polymorphism at ovin MCMA1, MCMA2, MCMA5, MCMA8, MCMA9, MCMA11, MCMA14, MCMA20, MCMA24, MCMA26 L loci. Animal Genetics, 31: 148-149. Mohammadi, G. and Saberivand, A. 2007. Molecular study of polymorphisms of some microsatellite markers linked to the FecB genes in Ghezel Iranian sheep. Iranian Veterinary Journal, 2: 34-43 (In Persian). Mohammadi, Y., Ghanbari, S., Darmani Koohi, H., Sataei Mokhtari, M. and Esmaeilizadeh Kashkooeiyeh, A. 2011. Comparison of genetic similarity estimated using pedigree information and a limited number of microsatellite markers. Journal of Modern Genetics, 6: 71-82 (In Persian). Mohammadifar, A. and Mohammadabadi, M. R. 2011. Application of microsatellite markers for a study of Kermani sheep genome. Iranian Journal of Animal Science, 4: 337-344 (In Persian). Montazeri, M., Masoudi, A. A. and Vaez Torshizi, R. 2012. Phylogenetic analysis in Iranian dog populations using 6 microsatellite markers. 5th congress of animal science, Isfahan University of Technology, 182-186. Musthafa Muneeb, M., Aljummah, R. S. and Alshaik, M. A. 2012. Genetic diversity of Najdi sheep based on microsatellite analysis. African Journal of Biotechnology, 1183: 14868-14876. Nanekarani, S. H., Amirinia, C., Mozafari, N. A., Vaez Torshizi, R. and Gharahdaghi, A. A. 2010. Genetic variation among Zandi sheep population using microsatellite markers. Veterinary Journal of Islamic Azad University, 11: 79-85 (In Persian). Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Gene, 89: 583-590. Pang, S. W. Y., Ritland, C., Carlson, J. E. and Cheng, K. M. 1999. Japanese quail microsatellite loci amplified with chicken-specific primers, Animal Genetics, 30: 195-199. Promega, C. 1993. DNA Silver Staining System, product DQ7050. Madison, WI, USA. Shannon, C. E. and Weaver, W. 1949. The mathematical theory of communication. 1st Edn. University of Illinois Press, Urbana, 125 pp. Soheir, M. E., Nahas, l., Amal, A., Hassan, Ahlam, A., Abou Mossallam, Eman. R., Mahfouz, Mona. A., Bibars, Hanaa, A., Oraby, S. and Hondt, H. A. 2008. Analysis of genetic variation in different sheep breeds using microsatellites. African Journal of Biotechnology, 7(8): 1060-1068. Sun, W., Chang, H., Hussein Musa, H. and Chu, M. 2010. Study on relationship between microsatellite polymorphism and producing ability on litter size of Hu sheep in China. African Journal of Biotechnology, 9(50): 8704-8711. Vajed Ebrahimi, M. T., Mohammad Abadi, M. R. and Esmailizadeh, A. 2015. Analysis of genetic diversity in Arabi sheep using microsatellites markers. 3st national congress of Livestock management, Shahid Bahonar University of Kerman, 166-170. Wang, Q. G., Zhong, F. G., Li, H., Wamg, X. H., Liu, S. R., Chen, X. J. and Gan, S. Q. 2005. Detection of major gene on litter size in sheep. Yi Chuan, 271: 80-84. Yeh, F. C., Yang, R. and Boyle, T. 1999. PopGene. Version 1.31. Microsoft Window–based Freeware for Population Genetic Analysis, University of Alberta. Edmonton, AB, Canada. Zahan, M., Miclea, V., Raica, P., Miclea, I. and Ilisiu, E. 2011. Analysis of genetic variation within Tsigai population from Romania using microsatellite markers. Bulletin UASVM Animal Science and Biotechnologies, 68: 1-2. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 647 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 547 |