
تعداد نشریات | 22 |
تعداد شمارهها | 485 |
تعداد مقالات | 5,052 |
تعداد مشاهده مقاله | 9,296,988 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,139,829 |
تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه HVR-I از ژنوم میتوکندری در گوسفند نژاد افشاری | ||
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
مقاله 8، دوره 6، شماره 1، خرداد 1394، صفحه 65-71 اصل مقاله (374.22 K) | ||
نوع مقاله: علمی - پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
زانا پیرخضرانیان* 1؛ مجتبی طهمورث پور2؛ آرزو محمدهاشمی3؛ نصرالله پیرانی4؛ مرجان ازغندی5 | ||
1دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد | ||
2استاد گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد | ||
3دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد | ||
4دانشیار گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهرکرد، شهرکرد | ||
5دانشجوی کارشناسیارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد | ||
چکیده | ||
خلوص ژنتیکی نژادهای گوسفند بهعلت تلاقیهای کنترل نشده دستخوش تغییر شده است، استفاده از نشانگرهای ژنتیکی توالییابی ژنوم میتوکندری، یکی از راههای بررسی این تغییرات است. هدف از این تحقیق بررسی میزان تنوع ناحیه HVR-I از ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد افشاری میباشد. برای این منظور از تعداد 20 رأس گوسفندان افشاری غیرخویشاوند نمونه خون جمعآوری و پس از استخراج DNA از آنها، ناحیه موردنظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR، تکثیر و قطعات موردنظر توالییابی شدند. با تجزیه دادههای حاصل، تعداد 5 هاپلوتیپ در این جمعیت شناسایی شد. مقایسه توالی HVR-I گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژادها، مشخص کرد این نژاد متعلق به گروه هاپلوتیپی A میباشد، همچنین مقایسه توالی مذکور گوسفند افشاری با منطقه مشابه در گروه هاپلوتیپی A از ژنوم گوسفندان سایر نژادها، نشان داد که گوسفند افشاری داری کمترین فاصله ژنتیکی با نژاد بلوچی و مغانی ایران میباشد. همچنین تجزیه و تحلیل درخت فیلوژنی رسم شده برای گروه هاپلوئیدی A نشان داد که احتمالاً قوچ و میش اوریال بهعنوان منشا نژاد افشاری و دو نژاد دیگر گوسفند محسوب میشود. | ||
کلیدواژهها | ||
ناحیه HVR-I – D-Loop؛ گوسفند افشاری؛ هاپلوتایپ | ||
مراجع | ||
Shafaq motlagh, A, 1386. Determination the mtDNA D - loop Sequence in goat and sheep breed, , Master thesis. Mashhad,iran
Mohammadhashemi, A. 1388, sequencing of HVR1 region of mtDNA in Iranian moghani sheep breed, Master thesis.tabriz.iran
Azor, P. Monteagudo, L. Luque, M. Tejedor, M. Rodero, E. Sierra I. Herrera, M. Rodero , A. and Arruga, M. 2005. Phylogenetic relationships among Spanish goats breeds. Animal genetics36(5): 423-425.
Cai, X. Chen, H. Lei, C. Wang, S. Xue, K. and Zhang, B. 2007. mtDNA diversity and genetic lineages of eighteen cattle breeds from Bos taurus and Bos indicus in China. Genetica, 131(2): 175-183.
Excoffier L, Laval G, Schneider S. Arlequin (version 3.0): an integrated software package for population genetics data analysis. Evolutionary bioinformatics online. 2005; 1: 47–50.
Ghovvati, S. Nassiri, M. R. Mirhoseini, S. Moussavi, A. H. and Javadmanesh, A. 2009. Fraud identification in industrial meat products by multiplex PCR assay. Food Control, 20(8): 696-699.
Hiendleder, S. Kaupe, B. Wassmuth, R. and Janke A. 2002. Molecular analysis of wild and domestic sheep questions current nomenclature and provides evidence for domestication from two different subspecies. Proceedings of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 269(1494): 893-904.
Hiendleder, S. Lewalski, H. Wassmuth, R. and Janke, A. 1998. The complete mitochondrial DNA sequence of the domestic sheep (Ovis aries) and comparison with the other major ovine haplotypeJournal of molecular evolution., 47(4): 441-448.
Kim, K. I. Lee, J. H. Li, K. Zhang, Y. P. Lee, S. S. Gongora, J and Moran, C. 2002. Phylogenetic relationships of Asian and European pig breeds determined by mitochondrial DNA D-Loop sequence polymorphism. Animal genetics, 33(1): 19-25.
Knudsen, B. Knudsen, T. Flensborg, M. Sandmann, H. Heltzen, M. Andersen, A. Dickenson, M. Bardram, J. Steffensen, P. Mønsted, S. Lauritzen, T. Forsberg, R. Thanbichler, A. Jannick, D. Görlitz, L. Rasmussen, J. Tordrup, D. Værum, M. Nygaard, M. Hachenberg, C. Fisker, E. Dekker, P. Schultz, J. Hein,M.K. and Sinding, J. 2007. CLC Main Workbench. Version 5.5. Aarhus, Denmark, CLC bio
Lalitha, S. 2000. Primer premier 5. Biotech Software & Internet Report: The Computer Software Journal for Scient, 1(6): 270-272.
Mohammadipestebik, F. Pirany, N. Shojaa, J. and Mohammadhashemi, A. 2011. Determination the mtDNA d-loop sequence in marandi native chicken population and its phylogenic relationships with other breeds. Animal science researches (faculty of agriculture, university of tabriz), 21(2): 1.
Naghash, H. S. Naderi, P. Taberlet. 2007. Large-Scale Mitochondrial DNA Analysis of the Domestic Goat Reveals Six Haplogroups with High Diversity. Plos one. Issue 10:1-10.
Nei, M. 1987. Molecular evolutionary genetics: Columbia University Press.
Pardeshi, V. Kadoo, N. Sainani, M. Meadows, J. Kijas,J. and Gupta, V. 2007. Mitochondrial haplotypes reveal a strong genetic structure for three Indian sheep breeds. Animal genetics, 38(5): 460-466.
Parvari, R. Avivi, A. Lentner, F. Ziv, E. Telor, S. Burstein,Y. and Schechter,I. 1988. Chicken immunoglobulin gamma-heavy chains: limited VH gene repertoire, combinatorial diversification by D gene segments and evolution of the heavy chain locus. The EMBO journal, 7(3): 739.
Pirani, N. Mohammadhashemi, A. Alijani, S. Rezazadeh, R. and Ghanbari, S. 2010. Molecular Analysis of Mazandrani native chicken population based on HVR-I region of Mitochondrial DNA. Journal Agriculture Biotechnology, 1(2): 53- 60.
Tamura, K. Peterson, D. Peterson, N. Stecher, G. Nei, M. and Kumar, S. 2011. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods Molecular biology and evolution, 28(10): 2731-2739.
Tapio, M. Marzanov, N. Ozerov, M. Ćinkulov, M. Gonzarenko, G. Kiselyova, T. Murawski, M Viinalass, H. and Kantanen, J. 2006. Sheep mitochondrial DNA variation in European, Caucasian, and Central Asian areas. Molecular biology and evolution, 23(9): 1776-1783.
Technelysium PL. Chromas lite version 2.01 2007.
Teletchea, F. Maudet, C. and Hänni, C. 2005. Food and forensic molecular identification: update and challenges. Trends in biotechnology, 23(7): 359-366.
Wood, N. and Phua, S. 1996. Variation in the control region sequence of the sheep mitochondrial genome Animal genetics, 27(1):25-33.
Zeder, M.A. Emshwiller, E. Smith, B. D. and Bradley, D. G. 2006. Documenting domestication: the intersection of genetics and archaeology. Trends in genetics, 22(3):139-155.
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,387 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,234 |