آمار
| تعداد نشریات | 22 |
| تعداد شماره‌ها | 485 |
| تعداد مقالات | 5,052 |
| تعداد مشاهده مقاله | 9,296,988 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,139,830 |
پیش‌بینی عملکرد پروتئین ناشناخته پاسخگو به تنش شوری در گندم دوروم | ||
| دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
| دوره 12، شماره 1، شهریور 1400، صفحه 59-66 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22084/ab.2022.24968.1470 | ||
| نویسندگان | ||
| شادی حیدری1؛ پیوند حیدری1؛ بهارک حیدری* 2 | ||
| 1دکتری، گروه اصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران | ||
| 2استادیار، گروه مهندسی کامپیوتر، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمانشاه، کرمانشاه، ایران | ||
| چکیده | ||
| شوری خاک یکی از مهم‌ترین عوامل کاهش عملکرد گندم دوروم در ایران است. پیشرفت فن‌آوری‌های با توان بالا در عین‌حال که روند تولید ارقام متحمل به تنش‌های محیطی را سرعت بخشیده است، با تولید داده‌های عظیم انفورماتیک ژنومی، تعیین عملکرد پروتئین‌های تازه کشف شده را به چالشی بزرگ تبدیل کرده است. از این‌رو هدف از این مطالعه، پیش‌بینی ساختار سوم و عملکرد پروتئین ناشناخته پاسخگو به تنش شوری در گندم دوروم بود. نتایج نرم‌افزار phyre نشان داد که ساختار سوم توالی پروتئین با E-value 1e-66 و دقت ارزیابی شده 87 درصد با پروتئین A0A452XZB6 دارای 385 باقی‌مانده، 25 هلیکس آلفا و 23 صفحه بتا از طبقه‌بندی ساختاری پروتئین Uniprotهمولوژی دارد. سایت STRING پیش‌بینی عملکرد این پروتئین را با تبادلگر Na+/H+ بومی‌سازی شده درغشا پلاسما مطابقت داد. پیش‌بینی دمین‌های تراغشایی، شناسایی اصلاحات و موتیف‌های اختصاصی پروتئین نشان دادند که فعال‌سازی این آنتیپورتر، احتمالاً توسط فسفوریلاسیون باقی‌مانده‌های سرین ترئونین انجام می‌شود و نقش مهمی در تحمل گندم دوروم به شوری داراست. این تحقیق چارچوبی برای مطالعات آینده در زمینه نقش تبادلگر +Na+/H غشا پلاسما و سهم نسبی آن در حفظ هموستاز+Na سلولی در تحمل ارقام گندم دوروم در خاک‌های شور فراهم می‌کند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تبادلگر +Na+/H غشا پلاسما؛ تحمل شوری؛ حفظ هموستاز+Na؛ ساختار سوم پروتئین | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 509 |
||