آمار
| تعداد نشریات | 22 |
| تعداد شماره‌ها | 485 |
| تعداد مقالات | 5,045 |
| تعداد مشاهده مقاله | 9,290,910 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,135,366 |
ارزیابی تنوع بیان پروتئین‌های محورجنین در دو رقم برنج با استفاده از الکتروفورز دوبعدی | ||
| دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
| دوره 10، شماره 1، شهریور 1398، صفحه 43-53 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22084/ab.2020.18624.1404 | ||
| نویسندگان | ||
| مهدی کاکایی* 1؛ سارا کیانی2 | ||
| 1استادیار گروه مهندسی کشاورزی (اصلاح‌نباتات و ژنتیک)، دانشگاه پیام‌نور، تهران، ایران | ||
| 2کارشناس ارشد، مرکز تحقیقات بیولوژی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران | ||
| چکیده | ||
| هدف از این مطالعه، ارزیابی و سنجش جامع تغییرات مولکولی ایجاد شده در بیان پروتئین‌های محور جنین برنج، با روش الکتروفورز دوبعدی می‌باشد. تنوع موجود در الگوی پروتئینی محور جنین، در دو رقم برنج متحمل و حساس به شوری (به‌ترتیب حسنی و سنگ‌جو) طی سه تکرار ارزیابی شد. درنتیجه‌ی آنالیز ژل‌های الکتروفورز دوبعدی در محور جنین برنج، 328 لکه تکرارپذیر مشاهده گردید که 63 لکه در سطح 1 درصد اختلاف معنی‌دار نشان دادند. از روش‌های آماری چندمتغیره، نظیر تجزیه خوشه‌ای و تجزیه تابع تشخیص جهت گروه‌بندی لکه‌های بیان شده در دو رقم سنگ‌جو و حسنی، استفاده گردید. اختلاف معنی‌دار بین دو رقم، نشان داد که احتمالاً رقم متحمل جهت مقابله با تنش شوری ویژگی تحمل به تنش را داشته‌اند. آنالیز خوشه‌ای، پروتئین‌ها را )از نظر بیان( در سه خوشه اصلی قرار داد که بیانگر وجود پروتئین‌هایی با بیان مشابه در هر خوشه است. این موضوع بیانگر عملکرد مشابه پروتئین‌های هر خوشه و حضور همه آن‌ها در مسیر بیولوژیکی مشترک می‌باشد. آنالیز تابع تشخیص نتایج حاصل از خوشه‌بندی را 100 درصد تأیید کرد که نشان از انطباق داده‌های پروتئینی با شرایط آزمایش دارد. باتوجه به تعداد بیش‌تر بیان لکه‌های افزایشی در رقم متحمل حسنی نسبت به تنش شوری، و کاهشی بودن بیان لکه‌ها در رقم حساس سنگ جو، می‌توان شناسایی ژن‌های مربوط به این پروتئین‌ها را پیشنهاد نمود. به‌طورکلی، نتایج نشان داد با استفاده از نرم‌افزار و آنالیزهای آماری، به سادگی می‌توان تغییرات بیان معنی‌دار ناشی از تفاوت رقم در سطح پروتئوم جنین را موردارزیابی قرار داد و شاخص تغییرات را مشخص نمود. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تجزیه چندمتغیره؛ تنش شوری؛ الکتروفورز پروتئین | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 180 |
||