دانشگاه بوعلی سینا

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات22
تعداد شماره‌ها485
تعداد مقالات5,045
تعداد مشاهده مقاله9,290,898
تعداد دریافت فایل اصل مقاله6,135,362
محمدی, سهیلا, طهماسبی, زهرا, عظیم زاده جمال کندی, صادق, حسینیان خوشرو, حمید, محمدی, رحمت. (1398). تحلیل نرم‌افزاری ژن‌ها و مسیرهای دخیل در تحمل به خشکی گیاه لوبیا (.Phaseolus vulgaris L). پژوهش های زبان شناسی تطبیقی, 10(2), 53-89. doi: 10.22084/ab.2021.21013.1429
سهیلا محمدی; زهرا طهماسبی; صادق عظیم زاده جمال کندی; حمید حسینیان خوشرو; رحمت محمدی. "تحلیل نرم‌افزاری ژن‌ها و مسیرهای دخیل در تحمل به خشکی گیاه لوبیا (.Phaseolus vulgaris L)". پژوهش های زبان شناسی تطبیقی, 10, 2, 1398, 53-89. doi: 10.22084/ab.2021.21013.1429
محمدی, سهیلا, طهماسبی, زهرا, عظیم زاده جمال کندی, صادق, حسینیان خوشرو, حمید, محمدی, رحمت. (1398). 'تحلیل نرم‌افزاری ژن‌ها و مسیرهای دخیل در تحمل به خشکی گیاه لوبیا (.Phaseolus vulgaris L)', پژوهش های زبان شناسی تطبیقی, 10(2), pp. 53-89. doi: 10.22084/ab.2021.21013.1429
محمدی, سهیلا, طهماسبی, زهرا, عظیم زاده جمال کندی, صادق, حسینیان خوشرو, حمید, محمدی, رحمت. تحلیل نرم‌افزاری ژن‌ها و مسیرهای دخیل در تحمل به خشکی گیاه لوبیا (.Phaseolus vulgaris L). پژوهش های زبان شناسی تطبیقی, 1398; 10(2): 53-89. doi: 10.22084/ab.2021.21013.1429

تحلیل نرم‌افزاری ژن‌ها و مسیرهای دخیل در تحمل به خشکی گیاه لوبیا (.Phaseolus vulgaris L)

دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی
دوره 10، شماره 2، اسفند 1398، صفحه 53-89
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22084/ab.2021.21013.1429
نویسندگان
سهیلا محمدی1؛ زهرا طهماسبی* 2؛ صادق عظیم زاده جمال کندی3؛ حمید حسینیان خوشرو4؛ رحمت محمدی4
1دانشجوی دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
2استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
3استادیار، مرکز تحقیقات آسیب‌های شیمیایی، انستیتو سیستم بیولوژی و مسمومیت ها، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله، تهران، ایران
4استادیار، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور، مراغه، ایران
چکیده
تنش‌های غیرزیستی ازجمله خشکی، رشد و توسعه گیاهان مانند لوبیا را تحت تأثیر قرارداده و واکنش‌های گیاه در برابر آن‌ها با تغییرات زیادی در شبکه‌های پیچیده ژنی همراه است. در پژوهش حاضر تغییرات در الگوی بیان ژن‌ها در شرایط تنش خشکی و نرمال گیاه لوبیا از طریق تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی اطلاعات EST اخذ شده از بانک اطلاعاتی NCBI موردبررسی قرار گرفت. پس از پیرایش اولیه، توالی‌های EST دسته‌بندی و یکپارچه‌سازی شدند که منجر به ایجاد 8983 ژن واحد در شرایط نرمال و 6665 ژن واحد در شرایط تنش خشکی گردید. گروه‌بندی و آنالیز غنی‌سازی ژنی، توالی‌های EST کتابخانه تحت تنش خشکی لوبیا را براساس فرآیندهای بیولوژیکی، عملکرد مولکولی و محتوای سلولی به‌ترتیب در 23، 16 و 20 گروه کارکردی مختلف در سطح آماری یک درصد قرار دادند. شبکه برهم‌کنش پروتئین- پروتئین نشان داد که ژن‌های رمزکننده آنزیم‌های آنتی‌اکسیدان (CAT1، APX1، APX3، APX1B، GSTU25)، پروتئین‌های غنی از پرولین (P5CS1، P5CS2)، پروتئین‌های شوک حرارتی (ATHSP70، HSP70b، ATHSP90.1، ATHSP90.5) و پروتئین‌های خانواده یوبی‌کوئیتین (UBQ3، UBQ11) سهم زیادی از شبکه تنظیمی را در شرایط کمبود آب به‌خود اختصاص داده‌اند. علاوه‌بر این، دریافتیم که بیان ژن‌های فتوسنتز کاهش نشان می‌دهد. در این مطالعه، تهیه لیستی از عوامل رونویسی (ازجمله RAP2.10، DEAR2، NF-YC9، WRKY40، ARF1، CDF2، ATCTH، ERF-1) به‌عنوان یکی از نقاط شاخص است که تاکنون با این میزان جزئیات در گیاه لوبیا گزارش نشده است و می‌تواند بسیار مهم و کاربردی باشد. ژن‌های شناسایی شده در این مطالعه می‌توانند نامزدهای مناسبی برای دست‌ورزی مقاومت به خشکی و اصلاح به‌کمک نشانگر در گیاه لوبیا باشند.
کلیدواژه‌ها
تنش غیرزیستی؛ EST؛ فاکتور رونویسی؛ ژنومیکس کارکردی
مراجع
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 302


سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب