آمار
| تعداد نشریات | 22 |
| تعداد شماره‌ها | 485 |
| تعداد مقالات | 5,052 |
| تعداد مشاهده مقاله | 9,296,988 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,139,829 |
تجزیه‌وتحلیل بیوانفورماتیک و بررسی بیان ژن‌های خانواده MAPKKK سیب‌زمینی در مواجهه با تنش‌های زیستی و غیرزیستی | ||
| دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
| دوره 11، شماره 1، شهریور 1399، صفحه 61-77 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22084/ab.2020.22564.1439 | ||
| نویسندگان | ||
| محسن نوروزی1؛ فرهاد نظریان فیروزآبادی* 2؛ احمد اسماعیلی2؛ رحیم احمدوند3 | ||
| 1دانشجوی دکتری، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران | ||
| 2استاد، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران | ||
| 3استادیار پژوهشی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، کرج، ایران | ||
| چکیده | ||
| پروتئین کینازکینازکینازهای فعال شونده با میتوژن (MAPKKK)، جز مهمی از آبشارهای پروتئین کیناز‌ها هستند که در پاسخ به انواع تنش‌های غیرزیستی و زیستی مانند حمله پاتوژن‌های گیاهی دخالت دارند. تحقیقات بسیاری بر روی ژن‌های MAPKKK گیاهان مختلف انجام شده است، ولی تاکنون مطالعه جامعی در مورد روابط تکاملی، ساختار و الگوی بیان پروتئین‌های MAPKKK در سیب‌زمینی انجام نشده است. در مطالعه حاضر، 114 ژن کدکننده‌ی MAPKKK با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیکی در ژنوم سیب‌زمینی شناسایی و براساس ارزیابی روابط فیلوژنتیکی به سه زیرخانواده RAF، ZIK و MEKK تقسیم شدند. تجزیه‌وتحلیل موتیف‌های محفوظ اعضای زیرخانواده‌های Raf، ZIK و MEKK گروه‌بندی درخت فیلوژنی را تأیید کرد. علاوه‌بر این، تجزیه‌وتحلیل پروفایل بیانی پروتئین‌های MAPKKK سیب‌زمینی نشان داد که این پروتئین‌ها در جریان بروز تنش‌های مختلف تنظیم می‌شوند. بررسی هشت ژن انتخابی براساس داده‌های RNA-Seq در تنش‌های گرما، سرما، شوری و تیمار Phytophthora infestans با استفاده از روش Real-time PCR، تغییرات سطح رونویسی بالایی را نشان دادند. این نتایج نشان می‌دهند که برخی از پروتئین‌های MAPKKK در سیب‌زمینی که در تنش‌ها غیرزیستی و زیستی مانند بیماری‌های قارچی تنظیم می‌شوند، می‌توانند انتخاب خوبی برای مطالعات بیش‌تر باشند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| آبشار Phytophthora infestans؛ MAPK؛ سیب‌زمینی؛ درخت فیلوژنتیکی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 836 |
||