
تعداد نشریات | 22 |
تعداد شمارهها | 486 |
تعداد مقالات | 5,053 |
تعداد مشاهده مقاله | 9,304,406 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,143,461 |
استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی برای مطالعه پروتئین مایوستاتین | ||
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
مقاله 6، دوره 6، شماره 2، آذر 1394، صفحه 45-49 اصل مقاله (845.55 K) | ||
نوع مقاله: علمی - پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
علی دیناری1؛ سیده نسیم طباطبایی پور2؛ علیرضا فتحی3؛ مرتضی هادی زاده* 4 | ||
1دانشجوی دکترایِ گروه نانو بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس تهران، تهران | ||
2دانش آموختهیِ کارشناسی ارشدِ گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد تهران، تهران | ||
3استادیارِ گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شیراز، شیراز | ||
4مدرسِ گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران | ||
چکیده | ||
ژن مایوستاتین متعلق به خانواده فاکتورهای تمایز رشد (TGF-β) میباشد که در رشد و نمو و بلوغ و بهطور اختصاصی در توسعه ماهیچه اسکلتی بالغ بیان میشود. در این پژوهش با بهره گیری از نرمافزارهای بیوانفورماتیکی، توالی اسیدآمینهای پروتئین مایوستاتین در گونههای مختلف ازجمله گاو، گوسفند، بز، اسب، خوک، مرغ، بوقلمون، اردک، غاز، کبوتر، موش و انسان بررسی شد. در همردیفی بخش پایانی پروتئین مایوستاتین (فرم فعال پروتئین مایوستاتین که بهصورت دایمر بیان میشود)، درجه بالایی از حفاظت شدگی مشاهده شد، بهطوریکه نوسان تغییرات در این بخش نسبت به سایر قسمتهای توالی پروتئینی، کمترین مقدار ممکن بود. با استفاده از سایتهای تخصصی Proteus و Phyre2 ساختارهای ثانویهای از قبیل مارپیچ آلفا، صفحات بتا و ساختار سه بعدی پروتئین مایوستاتین مورد بررسی قرار گرفت. اسیدآمینههای لوسین، لیزین، ایزولوسین و گلوتامیک اسید در گاو و گوسفند و بز فراوانی یکسانی را نشان دادند اما در مقایسه با ماکیان مانند مرغ، فراوانی بیشتری داشتند. حال آنکه فراوانی این اسیدآمینهها در توالی پروتئینی مایوستاتین انسان و خوک متوسط بود. بررسی درخت فیلوژنی نشان داد که تفاوت در توالی اسیدآمینهای مایوستاتین در بین گونههای یاد شده باعث قرار گرفتن پرندگان در گروهی جدا شده از پستانداران شده است. بررسی ساختار سه بعدی نشان داد که ژن مایوستاتین دارای حفاظت شدگی بالایی در گونه ها است. | ||
کلیدواژهها | ||
ابزارهای بیوانفورماتیکی؛ توالی پروتئینی؛ مایوستاتین | ||
مراجع | ||
Bellinge, R. H. S., Liberles, D. A., Laschi, S. P. A. O., Brien, P. A. and Tay, G. K. 2004. Myostatin and its implications on animal breeding: a review. International Society for Animal Genetics Animal Genetics, 36: 1-6.
Cassar-Malek, I., Passelaigue, F., Bernard, C., Jean, L. and Hocquette, J. F. 2007. Target genes of myostatin loss-of-function in muscles of late bovine fetuses. BMC Genomics, 8: 63.
Hadizadeh, M., Mohammadabadi, M., Niazi, A., Esmailizadeh, A., Mehdizadeh, Y. and Mollaei, A. 2013. Bioinformatics analysis of the GDF9 exon 2 in Tali and Beetal goats. Modern Genetics Journal, 3: 283-288.
Joulia-Ekaza, D. and Cabello, G. 2006. Myostatin regulation of muscle development: Molecular basis, natural mutations, physiological aspects. Experimental Cell Research, 312: 2401-14.
Khani, K., Abdolmohammadi, A., Foroutanifar, S. and Zebarjadi, A. 2014. Association of polymorphism in 5`UTR and exon1 regions of myostatin gene with twining trait in markhoz goat breed. Genetics in the 3rd Millennium Journal, 2: 3536-35543.
Malboobi, M., Feyzi, A. and Lohrasebi, T. 2010. Practical Guide to Data Processing of Biology and Genome Projects. pp. 113-115
Miar, Y., Salehi, A. R., AleYasin, S. A. and Raoufzadeh, S. 2011. Study of polymorphism in myostatin gene in Chaal, Zel and Zandi Iranian sheep breeds. Journal of Animal Production, 13: 33-40.
Mousavi-Movahedi, A., Jamni, A., Taghvi, A. and Moghadamnia, S. A. 2009. Proteins structure and function. Tehran University Press, Tehran, Iran. Page 202.
Nelson, D. L. and Cox, M. M. 2008. Principles of Biochemestry. 160 pp.
Soufy, B., Mohammadabadi, M. R., Shojaiyan, K., Baghizadeh, A., Farasaty, S., Askari, N. and Dayani, O. 2009. Evaluation of myostatin gene polymorphism in sanjabi sheep by PCR-RFLP. Journal of Animal Science Researches, 19: 81-90.
Thomas, M., Langley, B., Berry, C., Sharma, M., Kirk, S., Bass, J. and Kambadur, R. 2000. Myostatin, a negative regulator of muscle growth, functions by inhibiting myoblast proliferation. Journal of Biological Chemistry, 275: 40235-40243.
Uytterhaegen, L., Claeys, E. and Demeyer, D. 1994. Effects of exogenous protease effectors on beef tenderness development and myofibrillar degradation and solubility. Journal of Animal Science, 72: 1209-23. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,403 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,152 |