
تعداد نشریات | 22 |
تعداد شمارهها | 485 |
تعداد مقالات | 5,045 |
تعداد مشاهده مقاله | 9,291,038 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,135,411 |
تنوع ژنتیکی و صفات فیزیولوژیکی استرینهای Ralstonia solanacearum مزارع سیب زمینی استان همدان | ||
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی | ||
مقاله 3، دوره 6، شماره 2، آذر 1394، صفحه 23-31 اصل مقاله (475.98 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
سمیه اسفندیاری1؛ غلام خداکرمیان* 2 | ||
1دانشجوی سابق کارشناسیارشد بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدان | ||
2استاد بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدان | ||
چکیده | ||
بیماری پژمردگی باکتریایی ناشی از Ralstonia solanacearum از بیماریهای مهم سیبزمینی در استان همدان است. برای بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای R. solanacearum نمونههای گیاهی مشکوک به آلودگی در بهار و تابستان سال 1389 از مناطق مختلف این استان جمعآوری گردید. کشت اندامهای آلوده گیاهی (غده و ساقه) روی محیط نوترینت آگار (NA) حاوی تری فنیل تترازولیوم کلراید و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی، منجر به شناسایی 52 استرین R. solanacearum بیوار A2 گردید. برای تشخیص دقیقتر جدایهها واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای ps96H و ps96I انجام شد. نتایج PCR نشان داد که نمونهها همراه با نمونه استاندارد یک باند مشابه 148جفت بازی تولید نمودند. تنوع ژنتیکی 26 جدایه انتخابی با آغازگرهای BOX و ERIC مورد بررسی قرار گرفت. طول قطعات تکثیری با استفاده از آغازگر BOX A1R در محدوده 100 تا bp1500 و آغازگر ERIC از200 تا bp1200 متغیر بود. گروهبندی جدایههای بهدست آمده با روش UPGMA و براساس ضریب جاکارد با استفاده از دادههای هر دو آغازگـر، جـدایهها را در سطح تشابه 74 درصـد به 5 گروه اصـلی منتسب کرد. نتایج حاصل نشاندهـندهی آن است که استرینهای R. solanacearum جمعآوری شده خصوصیات فنوتیپی و ژنتیکی متفاوتی داشتند، هرچند ارتباط مشخصی بین منطقه جغرافیایی و خصوصیات استرینها بهدست نیامد. این بررسی کارآیی روشPCR با آغازگرهایBOX و ERIC را برای نشان دادن چندشکلی ژنتیکی در جمعیتهای R. solanacearum نشان داد. | ||
کلیدواژهها | ||
پژمردگی سیبزمینی؛ BOX؛ ERIC؛ بیوار2A؛ استان همدان | ||
مراجع | ||
Ausoble, F. M., Brent, R.., Kingston, R. E., Moore, D. D., Seidman, J. G., Smith, J. A. and Struhl, K. 2002. A compendium of method from current protocols in molecular biology. John Wiley and Sons, 900 pp.
Bahar, M., Nouri, S. H., Tasaodian, F., Samavatian, H. and Mortazavi, B. 2004. Comparison of different methods for detection of Ralstonia solanacearum in soil. Proceeding 16th Iran. Plant Protection. Congress. Tabriz. Iran. 226.
Bahar, M. and Danesh, D. 1988. Etiology of potato wilt in Iran. Plant Pathology, 24: 1-11.
Buddenhagen, I. W. and Kelman, A. 1964. Biological and Physiological aspects of bacterial wilt caused by Pseudomonas solanacearum. Phytopathology, 2: 203-230.
Debrujin, F. J. 1992. Use of repetitive (repetitive extragenic palindromic and enterobacter repetitive intergenic consensus) sequence and the polymerase chain reaction to fingerprint the genomes of Rhizobium meliloti isolates and other soil bacteria. Applied and Environmental Microbiology, 58: 2180-2187.
Cook, D., Barlow, E. and Sequeira, L. 1989. Genetic diversity of Pseudomonas solanacearum: Detection of restriction fragment length polymorphism with DNA probes that specify virulence and the hypersensitive response. Molecular Plant Microbe Interaction, 2: 113-121.
Fahy, P. C. and Haywerd, A. C. 1983. Media and methods for isolation and diagnostic tests. P. 337-378. In: Fahy, P. C. and Persley, G. J. (eds.). Plant Bacterial Disease, A Diagnostic Guide. Academic Press, Sydeny, Australia.
Fegan, M. and Prior, P. 2005. How complex is the Ralstonia solanacearum species complex. in: Bacterial wilt disease and the Ralstonia solanacearum Species Complex. Allen, C., Prior, P. and Hayward, A. C. eds. American Phytopathological Society, 26: 449-461.
Fouche-Wiech, J., Poussier, S., Trigalet-Demery, D., Berger, D. and Countinho, T. 2006. Molecular identification of some African strains of Ralstonia solanacearum from eucalyptus and potato. Genetic Plant Pathology, 72: 369-373.
Jaunet, T. X. and Wang, J. F. 1998. Variation in genotype and aggressiveness of Ralstonia solanacearum Race 1 isolated from tomato in Taiwan. Phytopathology, 89: 320-327.
Hayward, A. C. 1991. Biology and epidemiology of bacterial wilt caused by Pseudomonas solanacearum. Phytopathology, 29: 65-87.
Hayward, A. C. and Hartman, G. L. 1994. Bacterial wilt: The disease and its causative agent, Pseudomonas solanacearum. CAB International, 272 pp.
Hayward, A. C. 1995. Systematics and Phylogeny of Pseudomonas solanacearum and related bacteria. In: Horita, M. and Tsuchiya, K., (eds). Genetic diversity of Japanese strains of Ralstonia solanacearum. Phytopathology, 91: 399-407.
Hartung, F., Werner, R., Muhalbach, H. P. and Buttner, C. 1998. Highly specific PCR-diagnosis to determine Pseudomonas solanacearum strains of different geographical origins. Phytopathology, 96: 797-802.
Horita, M. and Tsuvhya, K. 2001. Genetic diversity of Japanese strains of Ralstonia solanacearum. Phytopathology, 91: 399-407.
Horita, M., Tsuvhya, K. and Ooshiro, A. 2005. Characteristics of Ralstonia solanacearum Biovar N2 strains in Asia. Phytopathology, 153: 209-213.
Irandoost, H., Niknam, G. H., Ghasemi, A., Taghavi, M. and Torabi, A. 2008. Evaluation of Genetic Diversity in East Azarbaijan and Fars Provinces Among Ralstonia solanacearum isolates by rep-PCR. Agricultural Sciences, 18: 234-242.
Izadian, M. and Taghavi, M. 2010. Genetic diversity of Ralstonia saolancearum biovars from same potato-growing region of Iran. Proceeding. 19th Iran. Plant Protection. Congress. Tehran. Iran. 403.
Karimi, M. and Harighi, B. 2010. Reaction of several potato cultivars to Ralstonia solanacearum, the causal agent of potato bacterial wilt in Kurdestan and Maekazi provinces. Proceeding. 19th Iran. Plant Protection. Congress. Tehran. Iran. 456.
Kelman, A., Hartman, G. L. and Hayward, A. C. 1994. Introduction. In: Bacterial wilt: the disease and its causative agent, Pseudomonas solanacearum (Ed. by Hayward, A. C. and Hartman, G. L.), pp. 1-7. CAB international, Wallingford, UK.
Khakvar, R., Sijam, K., Muiyan, M., Radu, S. and Kwaie, D. 2008. Improving PCR-based method for identification of Ralstonia solanacearum in natural sources of west Malaysia. Phytopathology, 3: 490-493.
Louws, F. J., Fulbright, D. W., Taylor-Stevens, C. and Debrujin, F. J. 1994. Specific genomic fingerprints of phytopathogenic Xanthomonas and Pseudomonas pathovars and strains generated with repetitive sequence and PCR. Applied and Environmental Microbiology, 60: 2286-2295.
Melanie, L., Brian, B., Gardner, M., Opina, N. and Miller, A. 2007. Diversity of Ralstonia solanacearum infecting eggplant in the Philippines. Phytopathology, 97: 1467-1475.
Mohamadi, S. A. and Parasanna, B. M. 2003. Analysis of genetic diversity in crop plants: Salient statistical tools and considerations. Crop Sciences, 43: 1235-1248.
Norman, D., Zapata, M., Gabrial, D., Duan, Y. and Yuene, J. 2009. Genetic diversity and host range variation of Ralstonia solanacearum strains entering North America. Phytopathology, 99: 1070-1077.
Nouri, S. H., Bahar, M. and Sharifnabi, B. 2004. Assess the genetic diversity of bacteria Ralstonia solanacearum race 3 isolates collected from potato areas of Iran. Proceeding 16th Iran. Plant Protection. Congress. Tabriz. Iran. 225.
Poussier, S., Trigalet, D., Vandewalle, P., Bruno, J. and Trigalet, A. 2000. Genetic diversity of Ralstonia solanacearum as assessed by PCR-RFLP of the hrp gene region AFLP and 16S rRNA Sequence analysis and identification of an African subdivision. Microbiology, 146: 1679-1692.
Prior, P. and Fegan, M. 2005. How complex is the Ralstonia solanacearum species complex. Pp. 449-461. In: Allen, C., Prior, P. and Hayward, A. C. (eds.). Bacterial Wilt Disease and the Ralstonia solanacearum Species Complex. APS, Press, St Paul, Minnesota USA, 510 pp.
Prior, P., Allen Ass, C. and Elphinstone, J. 1998. Bacterial Wilt Disease: Molecular and Ecological Aspects, Paris: INRA Editions.
Poussier, S., Trigalet, D., Vandewalle, P., Bruno, J. and Trigalet, A. 2000. Genetic diversity of Ralstonia solanacearum as assessed by PCR-RFLP of the hrp gene region AFLP and 16S rRNA Sequence analysis and identification of an African subdivision. Microbiology, 146: 1679-1692.
Robertson, AE., Fortnum, BA., Wood, TC. and Klueofel, DA. 2001. Diversity of Ralstonia solanacearum in the Southeastern United States. Beitrage zur Tabakforschung International, 19 (7): 323-331.
Schaad, N. W., Jones, J. B. and Chun, W. 2001. Laboratory Guide for the Identification of Plant Pathogenic Bacteria. 3rd Edn. Phytopathology, St. Paul, MN. pp: 398.
Seal, S. E., Jackson, L. A., Young, J. P. W. and Daniels, M. J. 1993. Differentiation of Pseudomonas solanacearum, Pseudomonas syzygii, Pseudomonas pickettii and the blood disease bacterium by partial 16S rRNA sequencing: constrution of oligonucletide primers for sensitive detection by polymerase chain reaction. Journal of General Microbiology,139: 1587-1594.
Smith, J. J., Offord, L. C., Holderness, M. and Saddler, G. S. 1995. Genetic diversity of Burkholderia solanacearum (Synonym: Pseudomonas solanacearum) race 3 in Kenya. Applied Environmental Microbiology, 61 (12): 4263-4268.
Taghavi, M., Hayward, C., Sly, L. and Fegan, M. 1996. Analysis of the phylogenetic relationships of strains of Burkholderia solanacearum, Pseudomonas syzygii and the blood disease bacterium of banana based on 16S rRNA gene sequences. Bacteriology, 46: 10-15.
Van Der Wolf, J. M., Bonants, P. J. M., Smith, J. J., Hagenaar, M., Nijhuis, E., Van Beckhoven, J. R. C. M., Saddler, G. S., Trigalet, A. and Feuillade, R. 1998. Genetic diversity of Ralstonia solanacearum race 3 in Western Europe determined by AFLP, RC-PFGE and Rep-PCR. Pp. 44-49. In: Prior P, Allen Ass. C. and Elphinstone, J. (eds). Bacterial Wilt Disease: Molecular and Ecological Aspects, Paris: INRA Editions.
Yabbuchi, E., Kosako, Y., Yan, I., Hotta, H. and Nishiuch, Y. 1995. Transfer of two Bukholderia and Alcaligenes species to Ralstonia gen. nov.: Proposal of Ralstonia pockettii (Ralston, Palleroni and Doudoroff, 1973) comb. nov. Rolstonia solanacearum (Smith, 1896) comb. nov. and Ralstonia eutropha (Divis, 1969) comb. nov. Microbiology and Immunology, 39 (11):897-904. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,826 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,203 |